RD-Embed: Unified representations of rare-disease knowledge from clinical records
RD-Embed は、臨床記録と SNOMED 由来のシグナルを統合しグラフ学習で洗練する 3 段階の表現フレームワークにより、既存モデルや大規模言語モデルを上回る精度で希少疾患の診断検索と遺伝子優先順位付けを可能にする軽量モデルである。
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genetic and genomic medicine
189 件の論文
Investigating the shared genetic architecture between chronic pain and depression
本論文は、大規模ゲノムワイド関連解析を用いてうつ病と慢性疼痛の遺伝的基盤を解明し、両疾患に共通する多数の遺伝子座と分子メカニズムを同定することで、その併存の病態理解と新たな治療標的の探索に貢献しました。
Genomic ascertainment of PALB2-related cancer predisposition
この研究は、大規模なコホートを用いたゲノムスクリーニングにより、PALB2 遺伝子変異保有者が乳がんや膵がんなど複数のがんリスクおよび死亡率の上昇を示すことを明らかにしたが、そのリスクは家系由来の集団で見られる推定値よりも低いことを示しました。
Highly Accurate Non-Invasive Preimplantation Genetic Testing for Monogenic and Polygenic Diseases from Spent Medium
本研究は、胚培養上清から得られる細胞フリー DNA を用いて、従来の生検を必要とせず、単一遺伝子疾患および多因子疾患（2 型糖尿病など）の両方に対して高い診断精度を達成する非侵襲的着床前遺伝子検査（niPGT）の新手法を開発したことを報告しています。
Biallelic WDR91 variants cause a neurodevelopmental disorder through impaired endosomal maturation and autophagy dysregulation
本研究は、WDR91 遺伝子の複合ヘテロ接合体変異がエンドソーム成熟の障害とオートファジーの調節異常を介して、進行性小頭症や早期発症てんかんを特徴とする重度の神経発達障害を引き起こすことを、患者由来細胞および細胞モデルを用いた機能解析により実証したものである。
What tools do men need to make an informed decision about germline genetic testing for prostate cancer: A qualitative and survey study
前立腺がん患者を対象とした質的および調査研究により、遺伝子検査に関する知識の欠如や家族への影響・保険差別への懸念といった課題が明らかになり、これらのニーズに対応するための情報ツールの開発とその有効性検証の必要性が示されました。
Functionality-Informed Fine-Mapping Dissects Common Variant Contributions to Coronary Artery Disease and Identifies Causal Variants and Pathways
この論文は、100 万人以上の欧州系個人からの GWAS 要約統計量を用いた機能情報に基づくベイズ型精细マッピング（SBayesRC）により、冠状動脈疾患の遺伝的リスクが脂蛋白機能、血管恒常性、細胞ストレス応答および炎症という 3 つの生物学的プロセスの乱れによって駆動されていることを明らかにし、PHACTR1、APOE、LPL などの因果変異を同定したことを報告しています。
A 5' UTR CCG expansion in TBC1D7 causes oculopharyngodistal myopathy
本研究は、TBC1D7 遺伝子の 5' UTR における CCG 反復配列の拡大が、欧米系および混血アフリカ系家系において新たな眼咽頭遠位型筋症（OPDM）の原因となり、非コード領域の反復配列の解析が未解決の神経筋疾患の解明に不可欠であることを示しました。
Genome-Wide Discovery Reveals Adipose-Specific and Systemic Regulators of Insulin Resistance
この研究は、最大 125 万人規模のゲノムワイド関連解析によりインスリン抵抗性の新たな遺伝的基盤を解明し、脂肪組織の機能不全がその中心的なメカニズムであることを示唆するとともに、新たな治療標的を提案するものです。
The Russian FSHD registry: a first look at the cohort
ロシアの FSHD 患者レジストリは、国際的なデータと比較して若年層が多く、D4Z4 反復数 3 の患者が優勢であることを示す大規模なコホート研究であり、クラスター分析によって疾患の進行経路が 3 つの異なるタイプに分類されることを明らかにしました。
Single-cell multi-omic integration analysis prioritizes druggable genes and reveals cell-type-specific causal effects in glioblastomagenesis
この研究は、単細胞マルチオミクスと GWAS を統合することで、グリア腫の発症に関与する遺伝的候補遺伝子を同定し、アストロサイトや少突膠前駆細胞など特定の細胞種における因果関係を解明することで、脳腫瘍の精密医療に向けたドラッグラブルな遺伝子ターゲットを特定しました。
SafeGene:A Novel Computational Platform for Predictive Genetic Screening of Offspring Disease Risk Using Region-Specific Population Genetics, Mendelian Inheritance Models, and Consanguinity Coefficient Analysis in Saudi Arabia and the Gulf Cooperation Council States
サウジアラビアおよび湾岸協力理事会諸国における高い血縁結婚率と遺伝性疾患の負担に対応するため、地域固有の集団遺伝学とメンデル遺伝モデルを統合し、50 以上の疾患リスクを予測する計算プラットフォーム「SafeGene」が開発され、年間数十億リヤルの医療費削減が見込まれることが示されました。
Sex-specific dissection of adiposity genetics reveals distinct pathways to endometrial cancer risk
200 万人のデータを用いた性特異的な肥満遺伝子解析により、肥満が子宮内膜癌のリスクに及ぼす影響の大部分が女性に特異的な遺伝的経路（ホルモン応答やインスリン・レプチンシグナルなど）を介して媒介され、そのメカニズムが解明されたことを明らかにした。
Assessing the clinical significance of a novel rare variant in Loeys-Dietz Syndrome by combining AI-driven modelling and cell biology
本研究では、AI を用いた分子モデリングと細胞実験を組み合わせることで、Loeys-Dietz 症候群患者に見出された新規変異 E431K が TGFBR2 機能に悪影響を及ぼし、同症候群の診断を確立したことを明らかにしました。
The Power of Partnership: Democratizing Genetic Prevalence to Empower Patient Advocacy
患者団体との連携により遺伝的有病率を推定するツール「GeniE」を開発し、ゲノムデータベースの更新に伴う推定値の変動を明らかにすることで、希少疾患の患者支援や創薬を促進する透明性のあるデータ基盤の構築を提案しています。
Genome-Wide Variations of End Motif in Cell-Free DNA Fragments Distinguish Immunotherapy Responders from Non-Responders in Head and Neck Cancer: A Multi-Institute Prospective Study
この研究は、頭頸部扁平上皮癌の免疫療法反応性を予測する新たなバイオマーカーとして、細胞フリー DNA の断片化パターン（5'末端モチーフ）の多様性を定量化する「rMDS」スコアを開発し、その臨床的有用性を多施設前向き試験で実証したものである。
Multivariate genome-wide association study dissects shared biology and disorder-specific loci across internalizing spectrum in millions of ancestrally diverse participants
数百万人の多祖先集団を対象とした大規模な多変量ゲノムワイド関連解析により、全般性不安障害、うつ病、PTSD の間で共有される生物学的基盤と疾患特異的な遺伝的リスク因子が解明され、前者は広範な細胞・調節メカニズム、後者は神経発達やシナプス、ストレス応答経路の特殊な擾乱にそれぞれ起因することが示されました。
Development and fit for purpose validation of a quantitative LC-MS/MS method for heparan sulfate in cerebrospinal fluid as a biomarker for mucopolysaccharidosis type IIIA
本論文は、ムコ多糖症 IIIA 型の中枢神経系基質負荷を評価するためのバイオマーカーとして、脳脊髄液中のヘパラン硫酸を定量する LC-MS/MS 法の開発と適合性検証、および臨床応用可能性を報告したものである。
FRMPD4, a causal gene for intellectual disability and epilepsy, is associated with X-linked non-syndromic hearing loss
FRMPD4 遺伝子変異が、これまで知られていた知的障害やてんかんに加え、非症候性難聴の原因遺伝子としても機能し、その聴覚機能における進化的に保存された役割を複数のモデル生物による解析で実証した。
Whole-Genome Landscape of Breast Cancers from India shows Distinct Clinically Actionable Subtypes
インドの乳がん患者 500 例超を対象とした大規模な全ゲノム・トランスクリプトーム解析により、新規変異遺伝子や代謝再プログラミングなどの新たな生物学的特徴を明らかにし、未だ研究が不足している南アジア集団に特異的な臨床的サブタイプや治療標的を同定することで、精密医療の進展に貢献しました。